পাতারহাট ইসলামিয়া ফাযিল মাদরাসাটি ১৯৪৪ সালে প্রতিষ্ঠিত হয়। প্রতিষ্ঠা করেন ছারছিনা শরীফের মরহুম পীরে কামেল শাহ্‌ সূফী হযরত মাওলানা নেছার উদ্দীন (রহঃ)। মাদরাসাটি মেহেন্দিগঞ্জ থানার অন্তরগত ঐতিয্যবাহি পাতারহাট বন্দরের উত্তর-পুর্ব পার্শ্বে অম্বিকাপুর গ্রামে অবস্থিত। মাদরাসাটির বর্তমাত অধ্যক্ষ জনাব হযরত মাওলানা আবদুশ শাকুর সাহেব।